La rivière Otava est l’une des rares rivières d’Europe avec une population originelle de truite de ruisseau et d’ombre commun. Grâce au travail de nombreuses personnes tant dans le parc naturel de la Šumava que des membres de la Fédération tchèque de pêche, l’on parvient à maintenir un effectif stable de ces poissons naturels.
La taille standard des poissons oscille dans le cas de la truite de ruisseau entre 20 et 45 cm. Pour l’ombre entre 25 et 47cm. Pendant l’année, certains pêcheurs arrivent toutefois à pêcher également des poissons ayant une taille record.
Des poissons destinés à la pêche commerciale, et ce avant tout la truite arc-en-ciel et l’omble d’Amérique, sont aussi introduits dans certaines sections de la rivière Otava en saison.
